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外周免疫器官包括淋巴结、脾脏和黏膜相关淋巴组织等。其中黏膜相关淋巴组织主要包括呼吸道、胃肠道及泌尿生殖道黏膜固有层和上皮细胞下散在的无被膜淋巴组织，以及某些带有生发中心的器官化的淋巴组织，如扁桃体、小肠的派氏集合淋巴结及阑尾等。