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蛋白尿是肾病最根本的变化。一方面由于肾小球滤过屏障解剖结构改变，使血浆中分子量较大的蛋白滤出（非选择性蛋白尿）；另一方面由于滤过膜表面阴电荷减少，使带阴电荷的蛋白（如白蛋白）大量由尿中丢失。其他还有免疫球蛋白、各种凝血因子、维生素D、结合蛋白亦从尿中丢失。持续大量蛋白尿能促进肾小球系膜硬化和间质病变，可导致肾功能不全。