膀胱尿道镜可在尿道、膀胱内进行全面的检查，用活检钳取活体组织做病理学检查；通过插管镜经双侧输尿管口插入输尿管插管，做逆行肾盂造影或收集肾盂尿送检，亦可进行输尿管套石术或安置输尿管支架做内引流。特殊的膀胱尿道镜包括电切镜等还可施行尿道、膀胱、前列腺、输尿管和肾的比较复杂的操作。尿道狭窄、膀胱炎症或膀胱容量过小不能做此检查。