鼠疫的发病有明显的季节性，南方的鼠疫（主要是腺鼠疫）多发生在春夏季节，青藏高原等地区的鼠疫（主要是肺鼠疫）多发生于夏秋季节。地区一般发生在自然疫源地内和毗邻地区。发病主要以青壮年为主，职业上以农民牧民为多。人间鼠疫流行多发生于动物间鼠疫之后，也与鼠类活动和鼠蚤繁殖密切相关。