照牙片只能了解牙槽骨或颌骨有无骨质破坏，因此A错误。CT、B超等不能对溃疡性质作出明确的诊断，因此B、C错误。细针吸活检适用于表面皮肤或黏膜完整的肿块，包括炎性肿块或肿瘤性肿块，因此E错误。对于颊侧牙龈溃疡3个月不愈，应高度警惕恶性肿瘤，明确诊断首先要采取切取活检的诊断方法，因此D正确。故选D。