引起根尖周疾病的化学因素多数由于药物使用不当造成；牙髓封失活剂过长，药物作用超出根尖孔，损失根尖周组织，造成炎症；根管封闭性药物，根管内强力冲洗，药物自根尖孔溢出，造成根尖周组织炎症；根充糊剂超填，超填的糊剂超出根尖孔，损失根尖周组织，造成炎症，但是窝洞消毒只局限在窝洞，不涉及根管内，所以不会影响根尖周组织，所以E选项正确，A、B、C、D选项错误。故本题选E。