新生隐球菌的主要传染源是鸽子，人因吸入鸽粪污染的空气而感染，特别是免疫低下者，可发生血行播散而累及中枢神经系统，主要引起肺和脑的急性、亚急性或慢性感染。白假丝酵母菌和卡氏肺孢菌亦是AIDS患者常见的机会致病菌，前者主要引起口腔念珠病，后者主要引起间质性肺炎。