华支睾吸虫（肝吸虫）从粪便或十二指肠液中查出虫卵为确诊依据。其中以改良加藤法、水洗倒置沉淀法、醛醚离心沉淀法及汞碘醛离心沉淀法（MIFC）检出率较高，而十二指肠引流物检出率最高。而免疫学方法包括皮内实验（ID）、间接血凝实验（IHA）、间接荧光抗体实验（IFAT）、酶联免疫吸附试验（ELISA）等免疫技术都能够辅助诊断该疾病，但是不能用于确诊。