脑脊液标本通常通过腰椎穿刺采集，特殊情况下可由小脑延髓池或侧脑室穿刺获得；标本采集后应该立即送检；标本抽取后分3管装，第1管做细菌培养，第2管做生化检查，第3管做显微镜检查。采集适应证有：有脑膜刺激征者；颅内出血、脑膜白血病或肿瘤颜内转移者；原因不明的剧烈头痛、昏迷、抽搐或偏瘫患者；脱髓鞘疾病者；中枢神经系统疾病椎管内给药治疗、麻醉和椎管造影者。禁忌证有颅内高压者；颅后窝占位者处于休克、全身衰竭状态者；穿刺局部有化脓性感染者。