培养基的质量控制包括外观、无菌试验、培养基的量、pH值、性能试验，外观要求标注清楚，澄清，无混浊，固体培养基应不干裂，无菌落生长，一般平板培养基2~8℃可贮存1~2周。用塑料袋密封冷藏可使用1个月。对于分装后进行灭菌的培养基应随机抽取5%～10%量进行无菌试验。斜面培养基的长度不超过试管的2/3，M-H平板的厚度应为4mm，其他平板厚度一般为3mm配制好的培养基其pH值应与规定的pH值相差±0.2之内。每一批新配制的、新购入的培养基均应用已知性质的标准菌株进行预测。对于分离培养基每周测试一次，鉴别培养基则需每批及每月测试一次。