本题考查咳嗽变异性哮喘的诊断。咳嗽变异性哮喘的诊断标准：1.咳嗽持续>4周，常在夜间或清晨发作加剧；2.临床上无感染征象，或抗生素治疗无效；3.抗哮喘治疗有效；4.排除其他原因引起的慢性咳嗽。本题患儿咳嗽3个月，常在夜间加重，抗生素治疗无效，考虑为咳嗽变异性哮喘，C项正确。