靶器官指某种有害物质首先在其中达到毒性作用的临界浓度的器官。有些物质作用于靶器官后其毒性作用直接由靶器官表现出来，此时效应器官就是靶器官；有些物质的毒性作用是通过靶器官以外的其他器官表现出来的，如有机磷农药的靶器官是神经系统，而效应器官是瞳孔、唾液腺等。因此，有机磷农药的靶器官是神经系统。