角膜是脂质-水-脂质的夹心层，这种结构脂溶性物质容易通过角膜上皮和内皮细胞层，水溶性制剂不能通过，但容易通过角膜基质层。因此只有药物具有水溶和脂溶两种特点时，才能通透完整的角膜。药物的结构与性质也影响药物在角膜的通透性。小分子水溶性物质和离子主要通过角膜上皮细胞间隙进入眼内。