《传染病防治法》规定，医疗机构发现甲类传染病（鼠疫、霍乱）时，应及时采取下列措施：对患者、病原携带者予以隔离治疗（不选A),隔离期限根据医学检查结果确定（选D)；对医疗机构内的患者、病原携带者、疑似患者的密切接触者，在指定场所医学观察和采取其他必要的预防措施（不选B)。拒绝隔离治疗或者隔离期未满擅自脱离隔离治疗的，可以由公安机关协助医疗机构采取强制隔离治疗措施（不选C)。隔离期间，被隔离人员有工作单位的，所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬（不选E)。