工程质量监督机构的监督检查以抽查为主，实行专项检查与综合检查相结合、工程实体质量检查与工程参建各方主体质量行为检查相结合的方式，故A、C选项正确，B选项错误；工程质量监督机构应配备必要的仪器设备，以满足日常检测工作需求，而不是定期抽查，D选项错误；听取施工现场相关人员关于工程质量控制措施、存在问题及处理意见，以及对分包工程管理等方面的汇报，也是工程质量监督人员的主要工作方式，E选项正确。本题正确答案是ACE。